※札幌市電、都電荒川線は含んでいません。

駅名変更の一覧を年度順で列挙します。
抜け漏れがあればご指摘いただけると助かります。
(参照したページは下に貼っておきます。仙台市、大阪市、神戸市に関しては調べた限りと言う形になります。統一的な文献がなかなか見つかりませんでした...)

社局名	路線名	変更日	旧駅名	新駅名	備考(理由など)
東京高速	(銀座)	1939/09/16	青山四丁目	外苑前
東京高速	(銀座)	1939/11/xx	青山六丁目	神宮前
営団	丸ノ内	1964/08/29	西銀座	銀座	日比谷線全線開通
名古屋	東山	1966/06/01	栄町	栄
名古屋	東山	1966/06/01	伏見町	伏見
大阪市	四つ橋	1969/07/01	信濃橋	本町	中央線本町駅本開業
東京都	三田(6号)	1969/08/01	志村	高島平
大阪市	四つ橋	1970/03/11	難波元町	難波	千日前線延伸開業
営団	銀座	1972/10/20	神宮前	表参道
東京都	浅草	1989/03/19	江戸橋	日本橋	新宿線本八幡開業
神戸市	西神山手	1993/03/20	山手(県庁前)	県庁前
札幌市	南北	1994/10/14	霊園前	南平岸	東豊線延伸開業
大阪市	谷町	1997/08/29	夕陽ケ丘	四天王寺前夕陽ヶ丘	長堀鶴見緑地線全通
大阪市	谷町	1997/08/29	関目	関目高殿	長堀鶴見緑地線全通
営団	有楽町	2004/04/01	営団赤塚	地下鉄赤塚	東京メトロへ
営団	有楽町	2004/04/01	営団成増	地下鉄成増	東京メトロへ
名古屋	東山	2004/10/06	藤ヶ丘	藤が丘
名古屋	桜通	2004/10/06	瑞穂運動場	瑞穂運動場西	瑞穂運動場東駅開業
大阪市	長堀鶴見緑地	2006/12/24	大阪ドーム前千代崎	ドーム前千代崎	今里筋線開業
名古屋	桜通	2023予定	中村区役所	太閤通	区役所移転
名古屋	名城	2023予定	市役所	名古屋城
名古屋	名城	2023予定	伝馬町	熱田神宮伝馬町
名古屋	名城	2023予定	神宮西	熱田神宮西

やはり駅名変更は延伸に合わせて行われることが多い。事業者の変更、駅の統合・開業、関連する施設の移転・名称変更が原因になることも多い。

札幌市
https://web.archive.org/web/20161223104511/http://www.stsp.or.jp/eki/st/n/index.html

東京都
https://www.kotsu.metro.tokyo.jp/about/service/pdf/kotsu_aramashi_2020.pdf

東京メトロ


名古屋市 



京都市


福岡市